2000年10月，省政府批準(zhǔn)組建江蘇省疾病預(yù)防控制中心，是直屬省衛(wèi)健委的公益性事業(yè)單位，2002年3月來(lái)，增掛省衛(wèi)生檢測(cè)檢驗(yàn)中心、省公共衛(wèi)生研究院?，F(xiàn)有江蘇路172號(hào)、邁皋橋122號(hào)兩處辦公區(qū)，下設(shè)部門(mén)（室、科、所）33個(gè)中業(yè)務(wù)科所20個(gè)、職能科所13個(gè)，編制695人，在職在編508人，碩士研究生以上學(xué)歷231人，高級(jí)技術(shù)職務(wù)249人，其中國(guó)務(wù)院特殊津貼2人，國(guó)家有突出貢獻(xiàn)中青年專(zhuān)家2人，省有突出貢獻(xiàn)中青年專(zhuān)家3人，省“333工程”人才17人。建有江蘇省國(guó)家突發(fā)急性傳染病防控隊(duì)、國(guó)家核和輻射突發(fā)事件衛(wèi)生應(yīng)急隊(duì)?，F(xiàn)有“十三五”科教強(qiáng)衛(wèi)工程創(chuàng)新平臺(tái)1個(gè)，重點(diǎn)學(xué)科1個(gè)，創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)2個(gè)，重點(diǎn)人才3人；主持國(guó)家級(jí)、省部級(jí)課題167項(xiàng)中科技部國(guó)家重大專(zhuān)項(xiàng)1項(xiàng)，科技部863計(jì)劃1項(xiàng)，國(guó)家自然科學(xué)基金30項(xiàng)；獲各級(jí)各類(lèi)科技獎(jiǎng)148項(xiàng)；承擔(dān)或參研國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)125項(xiàng)，發(fā)表論文4220篇，累計(jì)SCI收錄論文664篇中新英格蘭6篇、柳葉刀11篇，擁有軟件著作權(quán)81項(xiàng)、發(fā)明專(zhuān)利40項(xiàng)，實(shí)用新型專(zhuān)利40項(xiàng)，外觀設(shè)計(jì)3項(xiàng)，貢獻(xiàn)“強(qiáng)富美高”新江蘇建設(shè)大局。

中心堅(jiān)持以習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想為指導(dǎo)，在省委省政府和省衛(wèi)生健康委領(lǐng)導(dǎo)下，積極倡導(dǎo)“團(tuán)結(jié)、奮進(jìn)、求實(shí)、創(chuàng)新”疾控精神，履行疾病預(yù)防與控制、突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置等職能，有效應(yīng)對(duì)“非典”、新冠肺炎疫情，馳援5.12汶川特大地震抗震救災(zāi)工作，處置9.14湯山投毒、嬰幼兒毒奶粉、地溝油、小龍蝦事件，援助非洲塞拉利昂抗擊埃搏拉疫情，對(duì)口支援西藏拉薩、新疆伊犁和克州，保障北京奧運(yùn)、上海世博會(huì)，高質(zhì)量推進(jìn)建設(shè)具有國(guó)際影響力的現(xiàn)代化疾控中心，服務(wù)“健康江蘇”，獲中央文明委“全國(guó)文明單位”，衛(wèi)生部等部委“抗震救災(zāi)醫(yī)藥衛(wèi)生先進(jìn)集體”，人社部等部委“埃搏拉出血熱疫情防控先進(jìn)集體”，國(guó)家衛(wèi)生健康委“全國(guó)疾病預(yù)防控制工作先進(jìn)集體”，原國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委、中華全國(guó)總工會(huì)“全國(guó)衛(wèi)生應(yīng)急技能競(jìng)賽團(tuán)體一等獎(jiǎng)”，中華全國(guó)總工會(huì)“全國(guó)五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀”等國(guó)家級(jí)、省部級(jí)表彰近200項(xiàng)。